Drosophila melanogaster ribosomal DNA transcriptional repeat unit Ð complete sequence length 8120 bp tandem repeat_unit 1..8120 ribosomal DNA spacer 1..864 = external transcribed spacer (ETS) rRNA 865..2859 = small subunit ribosomal RNA (18S ribosomal RNA) spacer 2860..3585 = internal transcribed spacer 1 (ITS1) rRNA 3586..3708 = 5.8S ribosomal RNA spacer 3709..3736 = internal transcribed spacer 2a (ITS2a) rRNA 3737..3766 = 2S ribosomal RNA spacer 3767..4151 = internal transcribed spacer 2 (ITS2) rRNA 4152..8120 = large subunit ribosomal RNA (28S ribosomal RNA) TATAGGTAGGCAGTGGTTGCCGACCTCGCATTGTTCGAAATATATATTTCGTATAATGATTATATTGGTTACTTATAATAAAGTATATTATTATCCGTACAAATTTGTTTCTCAGTTCTTTTTGAACACGGGACTTGGCTCCGCGGATAATAGGAATATACGCTATTTTAGATAATATCGTTGAAACAAAAGTCAAGTTTCTATTATACATAGAATAACAAATCGTTTCCATATATTATCGTTAATTTTTGGTGGCAGGCAAATATTAGTTTATTACCTGCCTGTAAAGTTGGATTATTATATCGTTACGGTATAATACAAAATGGATTCATATTATTATATGAAAGAAATATAAAATTTATATATAAATTTGGAAGAATTATCATGTGCGCTCGGTTTTATGTTATATATTACCAGAGAGTTATATGAAAAGAGATAAATTTTAAATTTATCATCAAGATGCAAATGATTTAACTTATATTTGGTTAAACAAAAATTGTACAAGTGTGGATACAAAATTTATGTATGTTGGAAATAAAATGATATTTTAGAATGAAATATATGTATATATAAAGACAAAATTATAGAAAATATATTACAATAATTGTATGATCTTCTTGTTATATTGGTAAAACAAGTAGAATTTAAAAATGGAAATACGAATTACGAGTGCTATATAAAAATGGCCGTATTCGAATGGATTTATTTTTATAAATATATTTAAAATTTTTACCCAAAGGCAAAATATTGAATTACATTCAATAATATAAAAAAATGGAATTATATATAAAGTGGAAAATCTATAATATTTATATTGCTTATTTCAATTCAAAAAATATGAATGAAATATGAAAAGAAAACATTATTCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTTATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTACACACGAATTAAAAGTGAAACCGCAAAAGGCTCATTATATCAGTTATGGTTCCTTAGATCGTTAACAGTTACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCAATTAAAACATGAACCTTATGGGACATGTGCTTTTATTAGGCTAAAACCAAGCGATCGCAAGATCGTTATATTGGTTGAACTCTAGATAACATGCAGATCGTATGGTCTTGTACCGACGACAGATCTTTCAAATGTCTGCCCTATCAACTTTTGATGGTAGTATCTAGGACTACCATGGTTGCAACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCTAAGGAAGGCAGCAGGCGCGTAAATTACCCACTCCCAGCTCGGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACAGGACTCATATCCGAGGCCCTGTAATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACAAGGACCAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCGGTTAAAACGTTCGTAGTTGAACTTGTGCTTCATACGGGTAGTACAACTTACAATTGTGGTTAGTACTATACCTTTATGTATGTAAGCGTATTACCGGTGGAGTTCTTATATGTGATTAAATACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTCTTAAACGAGTGTTATTGTGGGCCGGTACTATTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTTAAAGCAGGCTTCAAATGCCTGAATATTCTGTGCATGGGATAATGAAATAAGACCTCTGTTCTGCTTTCATTGGTTTTCAGATCAAGAGGTAATGATTAATAGAAGCAGTTTGGGGGCATTAGTATTACGACGCGAGAGGTGAAATTCTTGGACCGTCGTAAGACTAACTTAAGCGAAAGCATTTGCCAAAGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTAGAGGTTCGAAGGCGATCAGATACCGCCCTAGTTCTAACCATAAACGATGCCAGCTAGCAATTGGGTGTAGCTACTTTTATGGCTCTCTCAGTCGCTTCCCGGGAAACCAAAGCTTTTGGGCTCCGGGGGAAGTATGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCGAACATAAGTGTGTAAGACAGATTGATAGCTCTTTCTCGAATCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTCGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACTCAAATATATTAAATAGATATCTTCAGGATTATGGTGCTGAAGCTTATGTAGCCTTCATTCATGTTGGCAGTAAAATGCTTATTGTGTTTGAATGTGTTTATGTAAGTGGAGCCGTACCTGTTGGTTTGTCCCATTATAAGGACACTAGCTTCTTAAATGGACAAATTGCGTCTAGCAATAATGAGATTGAGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTCCTGGGCTGCACGCGCGCTACAATGAAAGTATCAACGTGTATTTCCTAGACCGAGAGGTCCGGGTAAACCGCTGAACCACTTTCATGCTTGGGATTGTGAACTGAAACTGTTCACATGAACTTGGAATTCCCAGTAAGTGTGAGTCATTAACTCGCATTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATTATTTAGTGAGGTCTCCGGACGTGATCACTGTGACGCCTTGCGTGTTACGGTTGTTTCGCAAAAGTTGACCGAACTTGATTATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTATTGTATAATATCCTTACCGTTAATAAATATTTGTAATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGTTTTATTTATATAGTTAGTGTGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGTTGTGCGTATTTGTGGCGAGTACTTACAACAACGGCGTTTCCTATAAAAATAATGTTTCGAACATGAAAATCGAAGAAACAAAATTCGAAAGTGGAAGTCGAATCAAAATAAAATAATTTCGAATGTGTGGTAATCATCGAAATAAGTGTTAATATAATTGGTAGATATTAACTAATTTTTAAAATTTGTGTGTATTTATTACTATACACGCGTTGCGAATATGTATTGTTCATCTTAGTTATGGGCATACGTTGGCTAATGCAACAACCTGAAATAAACAATGTTGTACCTGGCATCCATCAGGTTAATGTTTTATATAAATTGCAGTATGTGTCACCCAAAATAGCAAACCCCATAACCAACCAGATTATTATGATACATAATGCTTATATGAAACTAAGACATTTCGCAACATTTATTTTAGGTATATAAATACATTTATTGAAGGAATTGATATATGCCAGTAAAATGGTGTATTTTTAATTTCTTTCAATAAAAACATAATTGACATTATATAAAAATGAATTATAAAACTCTAAGCGGTGGATCACTCGGCTCATGGGTCGATGAAGAACGCAGCAAACTGTGCGTCATCGTGTGAACTGCAGGACACATGAACATCGACATTTTGAACGCATATCGCAGTCCATGCTGTTATGTACTTTAATTAATTTTATAGTGCTGCTTGGACTACATATGGTTGAGGGTTGTAAGACTATGCTAATTAAGTTGCTTATAAATTTTTATAAGCATATGGTATATTATTGGATAAATATAATAATTTTTATTCATAATATTAAAAAATAAATGAAAAACATTATCTCACATTTGAATGTGAAAAACGAAGAGAAATATTTTCTTTTTCAATCAAATAATACTGAGAAATGTCTAGCATAAAAAATTGAAATATTTTTCATCTAGAATTGTCTCTTATTAATGATTCGGAAATAGAAAAATCTTGGTTATGTTATTATTCTTCGTTGGTTCGTTAAAAATGGATAAATAAAAACTTTGCATACAAGAATTAATAAAAATGTTATAACGAATTTAATTAAATGTTTTATCATTATATATAAAGAATTTATGGCAAGATAAAGTTATATACAACCTCAACTCATATGGGACTACCCCCTGAATTTAAGCATATTAATTAGGGGAGGAAAAGAAACTAACAAGGATTTTCTTAGTAGCGGCGAGCGAAAAGAAAACAGTTCAGCACTAAGTCACTTTGTCTATATGGCAAATGTGAGATGCAGTGTATGGAGCGTCAATATTCTAGTATGAGAAATTAACGATTTAAGTCCTTCTTAAATGAGGCCATTTACCCATAGAGGGTGCCAGGCCCGTATAACGTTAATGATTACTAGATGATGTTTCCAAAGAGTCGTGTTGCTTGATAGTGCAGCACTAAGTGGGTGGTAAACTCCATCTAAAACTAAATATAACCATGAGACCGATAGTAAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGAACTCTGAATAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAACTGCTTAGAGGTTAAGCCCGATGAACCTGAATATCCGTTATGGAAAATTCATCATTAAAATTGTAATATTTAAATAATATTATGAGAATAGTGTGCATTTTTTCCATATAAGGACATTGTAATCTATTAGCATATACCAAATTTATCATAAAATATAACTTATAGTTTATTCCAATTAAATTGCTTGCATTTTAACACAGAATAAATGTTATTAATTTGATAAAGTGCTGATAGATTTATATGATTACAGTGCGTTAATTTTTCGGAATTATATAATGGCATAATTATCATTGATTTTTGTGTTTATTATATGCACTTGTATGATTAACAATGCGAAAGATTCAGGATACCTTCGGGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATATGTGCAAGTTATTGGGATATAAACCTAAT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Differences between the consensus sequence reported here and that in Tautz et al. (1988). position 1 difference description 2 655 a-g 1063 a-g 2034 c-d 2168 c-d * 2621 d-g 4373 #-d 5452 t-a 5445-8 tgtg-atgt 5537 g-d 5837 d-a 5860 d-g 5944 c-d 6430 g-c ** 1 All numbers correspond to the consensus sequence in this figure. 2 The first nucleotide represents the consensus sequence. The second nucleotide, the Tautz et al. sequence. d = deleted nucleotide(s) * This difference corresponded to a variant present in 1-2% of the rDNA units. # = catttacccatagagggtgccaggcc ** This difference is present in the database in 60 reads all from the same sequencing strand, thus was considered sequencing error in this report.